汎固形腫瘍 CGPアッセイelio™ plasma completePGDx社
包括的なバイオマーカー分析とがん研究のための創製
PGDx elio™ plasma complete キットは、複雑な血液ベースのバイオマーカーの分析を可能にする包括的なゲノム プロファイリング (CGP) アッセイです。
侵襲的な腫瘍生検を行わずに、循環腫瘍 DNA を分析してがんの遺伝子変化を調べます。 必要な DNA インプット量が少ないにもかかわらず、SNV、indels、bTMB、MSI、LOH、および選択された増幅と転座を含む 500 以上の遺伝子を包括的パネルを評価します。
elio™ plasma complete は、世界中で使用できるように設計されており、研究者が迅速かつ信頼性の高い包括的な洞察を得ることができるようになり、世界中のがん研究の進歩に役立ちます。
製品詳細
分析性能
| 変異体 | 報告範囲 | 分析感度 | 分析特異性 |
|---|---|---|---|
| Actionable SNVs/indels | > 0.1% VAF | 0.40% VAF | 100% |
| Non-actionable SNVs/indels | ≧ 0.5% VAF | 1.16% VAF | 99.9% |
| All translocations | ≧ 3 fusion reads | 0.33% VAF | 100% |
| All amplifications | ≧ 1.15 – fold | 1.32 – fold | 100% |
製品仕様
| パネルサイズ | 2.1 MB |
|---|---|
| パネル内容 および 変異体タイプ | 521 genes for SNVs and indels 38 genes for amplifications 21 genes for translocations bTMB (Muts/Mb) MSI status LOH status |
| サンプルタイプ | 血漿 cfDNA (Streck または EDTA) |
| cfDNA投入量 | 推奨 25 ng (最小 10 ng) |
| ワークフロー | 手動または自動 |
| サンプル合格率 | 97.8% (全体合格率) |
| シーケンスプラットフォーム | NovaSeq 6000 |
| 読み取り長 | 2 x 150 bp |
| シーケンス実行ごとの症例数 | 16サンプル on S2フローセル |
| 平均合計カバレッジ | 20,000x |
